Haliç köprüsü ile E-5 karayolunu birleştiren tünel yapımında , tünelin üstündeki bir kısım şehitlerin kabirleri buradan alınıp başka bir yere nakledilmiştir. Zamanla kaybolan Sır Tekke burada olduğu tahmin edilmektedir.
Mezarlığın içerisinde " Necatibey Mezarlığı " adı verilen bölümde eski mezarlar bulunmaktadır. Cevreyolu ile Rami caddesini bağlayan yol yapımında mezarlık bölümündeki mezarlar tahibata uğramıştır.
Edirnekapı Şehitliğinde ; Osmanlı dönemi şehitler ve normal ölenler , Balkan Savaşı , I. Dünya Savaşı , Çanakkale Savaşları'nda yaralanıp İstanbul hastanelerinde tedavi esnasında şehit olanlar , Osmanlı-Rus Harbi, Balkan Harbi şehitleri, Kara, Deniz ve Hava Kuvvetleri şehitleri, Polis Teşkilatı'nın şehitleri, T.H.Y. sivil şehitleri, İtfaiye Teşkilatı'nın şehitleri, Eski Tulumbacılar ve Harp Malul ve Gazileri şehitleri yatmaktadır.
Edirnekapı Şehitliği 1926 yılında kurulan " Türkiye Şehitlikleri İmar Vakfı " sorumluluğundadır.
