Cacabey medresesi kare planlı olup kesme taşlarla örülü , İki eyvanlı kapalı avluludur. Mukarnas kavsaralı iki renkli taş işçiliğinin uygulandığı taç kapısı bulunmaktadır. Kuzeyindeki giriş kapısı işlemelidir. Minaresi yapıdan ayrı olarak tel şerefeli ve çinilidir. Caminin sol tarafında Cacabey'in türbesi bulunmaktadır.
Cacabey Medresesi, diğer Anadolu Selçuklu medreseleri ile birlikte 2014 yılında UNESCO Dünya Mirası Geçici Listesine dahil edilmiştir