Çanakkale Boğaz Komutanlığı, 2000'li yılların başında Seramik Müzesi olarak , kullanılmak için Çanakkale Belediyesi'ne devremiştir. Çanakkale Belediyesi gerekli restorasyon çalışmaları yaparak Çanakkale Seramik Müzesi olarak kullanıma hazırlamıştır.
2008 yılında Çanakkale Valiliği , Çanakkale Belediyesi , ÇOMÜ, Çanakkale Boğaz Komutanlığı , Rotary Klubü , STK’lar ve gönüllüler bir araya gelerek Kent Konseyi çatısı altında bir çalışma grubu oluşturdular ve Çanakkale Seramik Müzesinin kurulum çalışmalarını başlattılar. 2013 yılında hizmete açılmıştır.