Üç Ayak Kilisesi günümüze ulaşan herhangi bir belge ve kitabesi olmadığından yapıldığı ve kullanıldığı dönemlerdeki ismi bilinmiyor. Kilisenin üçü önde ve üçü arkada olan altı tane kolon bulunur , önden veya arkadan bakıldığında kolonlar üçer ayak görünür , yöre halkı bu görünüşe üçayak ismi verdiğinden bu isim ile halk tarafından söylenir.