Fatih Sultan Mehmet Konstantinopolis'i fethettikten sonra , Osmanlı Türkleri tarafından gözetleme kulesi olmuştur.
Kız Kulesi yüzyıllardan beri , geceleri yanan feneriyle , Marmara denizinden geçen gemilere yol göstermektir.
Kız Kulesi , 1509 İstanbul depreminde yıkıldığında yeniden yapılır. 1721'de çıkan yangında , yanmış , Sadrazam Damat İbrahim Paşa tarafından yeniden yapılır. 1731 - 1734 - 1763 yeniden onarılmıştır.
1829 yılında bulaşıcı bir hastalıklar için karantina istasyonu olarak kullanılmış.
1832'de Sultan II. Mahmud tarafından onarılmış. 1945'te liman yönetimine katılır.
1998 yılında onarılımıştır.
James Bond'un Dünya Yetmez filmi çekiminde yer almıştır.